По входному билету посетителю предоставляется возможность посетить пять основных выставок учреждения: «Время мамонта», «Пересечение трех миров», «Человек Севера», «Через центр России к Карскому морю», «На полпути земного бытия» и десять временных, действующих на момент посещения, экспозиций.
В ходе визита можно увидеть уникальные экспонаты: скелеты Монгоченского мамонта (геологический возраст – около 17 000 лет) и шерстистого носорога, мумию мамонтенка Люба (геологический возраст – 42 000 лет), найденную в 2007 году, мумию средневекового воина (1282 г.).