Лилия Якушева родилась в 1993 году в Курске. В музыкальном колледже им. Г. Ф. Свиридова обучалась по классу фортепиано, а заниматься игрой на органе начала самостоятельно в курском римско-католическом храме Успения Божьей Матери. В 2017 году поступила в МГК им. П. И. Чайковского в класс заслуженного артиста РФ профессора А. А. Паршина.

Лауреат Всероссийского открытого фестиваля-конкурса органной музыки «Золотая Лира», X Московского открытого фестиваля-конкурса молодых исполнителей старинной музыки имени Леопольда Моцарта, VI Международного конкурса органистов Валерия Кикты, обладательница гран-при II Всероссийского конкурса музыкантов-исполнителей «Лестница мастерства» и I Всероссийского конкурса исполнителей этюдов и виртуозных пьес.

Ведет активную концертную деятельность, выступая в городах России с сольными программами и в составе ансамблей. Участница фестивалей «Музыкальное приношение Иоганну Себастьяну Баху», (РАМ им. Гнесиных), Московского международного органного фестиваля (МГК им. Чайковского), Международного фестиваля «Фрау Орган» (г. Челябинск) и др.. В октябре 2021 года дебютировала на IX Международном органном фестивале «Мариинский».

В программу включены произведения для органа немецких и французских композиторов XVII - XIX веков: И. С. Баха, И. Пахельбеля, Г. Бёма, Н. Брунса, А. Г. Риттера, Л. Дж. Лефебюр-Вели